AT4G04510.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.847 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 38 (CRK38); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: trichome, stamen; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 39 (TAIR:AT4G04540.1); Has 124024 Blast hits to 122575 proteins in 4576 species: Archae - 110; Bacteria - 14079; Metazoa - 45461; Fungi - 10821; Plants - 34799; Viruses - 466; Other Eukaryotes - 18288 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:2242122..2244656 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72923.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 648 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKNSAAIFLT SSLILLLQTL HGVKAGFICV GSSFPTNSSY QKNRDSLFST LSDKVTTNGG FYNASLDGVH VVGLCRRDYD RQGCINCVEE SIRQIKTSCS 101: NRVQSFHCNS DDRERVSCLV RTTDQSTYRI LELGPATNDP SPVAIDTFAK NMTLFRQEWE AMVDRTLEAV TIDNSTTVLK YYGALKSEFS EFPNVYMMMQ 201: CTPDINSGAC KRCLQASVTY FRDQNWGRQG GGICRPSCVF RWEFYPFYGA FANVTRVPAP PRALIPRTEA ISITRLKGGI IAIFVVPIVI NLLVFIGLIR 301: AYTRIRKSYN GINEAQYDYG GQSKLRFDFR MILTATDDFS FENKIGQGGF GSVYKGKLPG GEEIAVKRLT RGSGQGEIEF RNEVLLLTRL QHRNLVKLLG 401: FCNEGDEEIL VYEFVPNSSL DHFIFDEEKR LLLTWDMRAR IIEGVARGLV YLHEDSQLRI IHRDLKASNI LLDAYMNPKV ADFGMARLFN MDQTRAVTRK 501: VVGTFGYMAP EYVRNRTFSV KTDVYSFGVV LLEMITGRSN KNYFEALGLP AYAWKCWVAG EAASIIDHVL SRSRSNEIMR FIHIGLLCVQ ENVSKRPTMS 601: LVIQWLGSET IAIPLPTVAG FTNASYQAEH EAGTLSLNEL SITELSPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)