AT4G03240.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : frataxin homolog | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes AtFH, a frataxin homolog. Frataxin is required for the biogenesis of mitochondria in different organisms. AtFH knock-out mutants are lethal. Required for full activity of mitochondrial Fe-S proteins. Deficiency of AtFH induces oxidative stress. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
frataxin homolog (FH); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Frataxin (InterPro:IPR017789), Frataxin conserved site (InterPro:IPR020895), Frataxin-like (InterPro:IPR002908); Has 1148 Blast hits to 1148 proteins in 551 species: Archae - 0; Bacteria - 783; Metazoa - 128; Fungi - 127; Plants - 48; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 62 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:1423685..1424758 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21431.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 187 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATASRFLLR KLPRFLKLSP TLLRSNGVRV SSNLIQDSIE PLDSFWRIGS RIRHDSLTTR SFSSQGPASV DYSSVLQEEE FHKLANFTIN HLLEKIEDYG 101: DNVQIDGFDI DYGNEVLTLK LGSLGTYVLN KQTPNRQIWM SSPVSGPSRF DWDRDANAWI YRRTEAKLHK LLEEELENLC GEPIQLS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)