AT4G02060.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Member of the minichromosome maintenance complex, involved in DNA replication initiation. Abundant in proliferating and endocycling tissues. Localized in the nucleus during G1, S and G2 phases of the cell cycle, and are released into the cytoplasmic compartment during mitosis. Binds chromatin. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PROLIFERA (PRL); FUNCTIONS IN: protein binding, DNA-dependent ATPase activity, DNA binding, ATP binding; INVOLVED IN: sugar mediated signaling pathway, cell proliferation, DNA-dependent DNA replication initiation, DNA unwinding involved in replication; LOCATED IN: nuclear chromatin, nucleus, cytoplasm; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleic acid-binding, OB-fold-like (InterPro:IPR016027), Nucleic acid-binding, OB-fold (InterPro:IPR012340), ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), DNA-dependent ATPase MCM (InterPro:IPR001208), DNA-dependent ATPase MCM, conserved site (InterPro:IPR018525), MCM protein 7 (InterPro:IPR008050); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein (TAIR:AT5G44635.1); Has 4609 Blast hits to 4442 proteins in 796 species: Archae - 407; Bacteria - 660; Metazoa - 1239; Fungi - 945; Plants - 433; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 923 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:901484..905297 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 80337.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 716 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKDHDFDGDK GLAKGFLENF ADANGRSKYM EILQEVSNRK IRAIQVDLDD LFNYKDESEE FLGRLTENTR RYVSIFSAAV DELLPEPTEA FPDDDHDILM 101: TQRADDGTDN PDVSDPHQQI PSEIKRYYEV YFKAPSKGRP STIREVKASH IGQLVRISGI VTRCSDVKPL MAVAVYTCED CGHEIYQEVT SRVFMPLFKC 201: PSSRCRLNSK AGNPILQLRA SKFLKFQEAK MQELAEHVPK GHIPRSMTVH LRGELTRKVS PGDVVEFSGI FLPIPYTGFK ALRAGLVADT YLEATSVTHF 301: KKKYEEYEFQ KDEEEQIARL AEDGDIYNKL SRSLAPEIYG HEDIKKALLL LLVGAPHRQL KDGMKIRGDV HICLMGDPGV AKSQLLKHII NVAPRGVYTT 401: GKGSSGVGLT AAVMRDQVTN EMVLEGGALV LADMGICAID EFDKMDESDR TAIHEVMEQQ TVSIAKAGIT TSLNARTAVL AAANPAWGRY DLRRTPAENI 501: NLPPALLSRF DLLWLILDRA DMDSDLELAK HVLHVHQTEE SPALGFEPLE PNILRAYISA ARRLSPYVPA ELEEYIATAY SSIRQEEAKS NTPHSYTTVR 601: TLLSILRISA ALARLRFSES VAQSDVDEAL RLMQMSKISL YADDRQKAGL DAISDTYSII RDEAARSKKT HVSYANALNW ISRKGYSEAQ LKECLEEYAA 701: LNVWQIDPHT FDIRFI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)