AT4G01940.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NFU domain protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein containing the NFU domain that may be involved in iron-sulfur cluster assembly. Part of a five member gene family, more closely related to NFU2 and 3 than to NFU4 and 5. Targeted to the chloroplast. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NFU domain protein 1 (NFU1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NIF system FeS cluster assembly, NifU, C-terminal (InterPro:IPR001075); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NIFU-like protein 2 (TAIR:AT5G49940.1); Has 4565 Blast hits to 4561 proteins in 1155 species: Archae - 11; Bacteria - 2225; Metazoa - 159; Fungi - 160; Plants - 186; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1821 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:842265..843388 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24769.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 231 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMASLATSIS GSFRILVKSS STRNGFPVIS DQNPSFVLFA NKRRHISRTA IFHRSAISGS SQGEKISPLA SGVSSGLYSA QTFDLTPQNV DLVLEDVRPF 101: LISDGGNVDV VSVEDGVVSL KLQGACTSCP SSSTTMTMGI ERVLKEKFGD ALKDIRQVFD EEVKQITVEA VNAHLDILRP AIKNYGGSVE VLSVEGEDCV 201: VKYVGPESIG MGIQAAIKEK FKDISNVTFT S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)