AT4G01900.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GLNB1 homolog | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a PII protein that may function as part of a signal transduction network involved in perceiving the status of carbon and organic nitrogen. Forms a protein complex with N-acetylglutamate kinase and regulates the kinase activity by relieving the feedback inhibition of the kinase by arginine. Regulates acetyl-CoA carboxylase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
GLNB1 homolog (GLB1); FUNCTIONS IN: acetylglutamate kinase regulator activity; INVOLVED IN: response to light stimulus, nitrogen compound metabolic process, regulation of arginine biosynthetic process via ornithine, anthocyanin biosynthetic process, response to sucrose stimulus; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nitrogen regulatory protein PII/ATP phosphoribosyltransferase, C-terminal (InterPro:IPR015867), Nitrogen regulatory protein PII (InterPro:IPR002187), Nitrogen regulatory protein PII, conserved site (InterPro:IPR017918), Nitrogen regulatory PII-like, alpha/beta (InterPro:IPR011322); Has 6977 Blast hits to 6975 proteins in 1636 species: Archae - 359; Bacteria - 5100; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 60; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1458 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:821736..823294 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21276.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 196 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAASMTKPIS ITSLGFYSDR KNIAFSDCIS ICSGFRHSRP SCLDLVTKSP SNNSRVLPVV SAQISSDYIP DSKFYKVEAI VRPWRIQQVS SALLKIGIRG 101: VTVSDVRGFG AQGGSTERHG GSEFSEDKFV AKVKMEIVVK KDQVESVINT IIEGARTGEI GDGKIFVLPV SDVIRVRTGE RGEKAEKMTG DMLSPS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)