AT4G01710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ARP2/3 complex 16 kDa subunit (p16-Arc) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
belongs to the DIS(distorted) gene family. Encodes a actin polymerization factor. Involved in cell expansion of trichome. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CROOKED (CRK); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ARP2/3 complex 16kDa subunit (p16-Arc) (InterPro:IPR006789); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ARP2/3 complex 16 kDa subunit (p16-Arc) (TAIR:AT5G65274.1); Has 360 Blast hits to 360 proteins in 109 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 256; Fungi - 50; Plants - 40; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 14 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:735776..736450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14973.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 132 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEFVEADNA EAIIARIETK SRKIESLLKQ YKHVEALKTA LEGSPPKTRD ERCKSANWIV VHRALMAIKD IDGMLNALDV EYYDILMKYL YRGLSTGDRP 101: TCDQCLKIHE KLTERAGLGC ILRCLTDTIN TV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)