AT4G00400.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glycerol-3-phosphate acyltransferase 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Involved in cutin assembly. Is functionally redundant with GPAT4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glycerol-3-phosphate acyltransferase 8 (GPAT8); FUNCTIONS IN: glycerol-3-phosphate O-acyltransferase activity, acyltransferase activity; INVOLVED IN: metabolic process, cutin biosynthetic process; LOCATED IN: endoplasmic reticulum; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phospholipid/glycerol acyltransferase (InterPro:IPR002123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glycerol-3-phosphate acyltransferase 4 (TAIR:AT1G01610.1); Has 380 Blast hits to 369 proteins in 27 species: Archae - 0; Bacteria - 6; Metazoa - 8; Fungi - 0; Plants - 360; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:174312..176734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55870.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 500 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSPEKKSQNF PPITECRDGE YDSIAADLDG TLLLSRSSFP YFMLVAVEAG SLLRGLILLL SLPFVIISYL FVSESLGIQI LIFISFAGLK IRDIELVSRA 101: VLPRFYAADV RKDSFEVFDK CKRKVVVTAN PIVMVEAFVK DYLGGDKVLG TEIEVNPKTN RATGFVKKPG VLVGDLKRLA ILKEFGNESP DLGLGDRTSD 201: HDFMSLCKKG YMVHATKSAT TIPKERLKNR IVFHDGRLAQ RPTPLNAIIT YLWLPFGFIL SIIRVYFNLP LPERFVRYTY EMLGIHLTIR GHRPPPPSPG 301: TLGNLYVLNH RTALDPIIVA IALGRKICCV TYSVSRLSLM LSPIPAVALT RDRATDAANM RKLLEKGDLV ICPEGTTCRE EYLLRFSALF AELSDRIVPV 401: AMNCKQGMFN GTTVRGVKFW DPYFFFMNPR PSYEATFLDR LPEEMTVNGG GKTPIEVANY VQKVIGAVLG FECTELTRKD KYLLLGGNDG KVESINNTKK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)