AT3G63410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a MPBQ/MSBQ methyltransferase located in the chloroplast inner envelope membrane. Mutant plants lack plastoquinone (PQ), suggesting that the APG1 protein is involved in the methylation step of PQ biosynthesis. The gene product is also involved in tocopherol (vitamin E) biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ALBINO OR PALE GREEN MUTANT 1 (APG1); FUNCTIONS IN: S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity, methyltransferase activity, 2-methyl-6-phytyl-1,4-benzoquinone methyltransferase activity; INVOLVED IN: plastoquinone biosynthetic process, vitamin E biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast inner membrane, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Methyltransferase type 11 (InterPro:IPR013216); Has 7919 Blast hits to 7917 proteins in 1885 species: Archae - 394; Bacteria - 5939; Metazoa - 115; Fungi - 139; Plants - 226; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1106 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:23415816..23417002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37928.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 338 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASLMLNGAI TFPKGLGSPG SNLHARSIPR PTLLSVTRTS TPRLSVATRC SSSSVSSSRP SAQPRFIQHK KEAYWFYRFL SIVYDHVINP GHWTEDMRDD 101: ALEPADLSHP DMRVVDVGGG TGFTTLGIVK TVKAKNVTIL DQSPHQLAKA KQKEPLKECK IVEGDAEDLP FPTDYADRYV SAGSIEYWPD PQRGIREAYR 201: VLKIGGKACL IGPVYPTFWL SRFFSDVWML FPKEEEYIEW FKNAGFKDVQ LKRIGPKWYR GVRRHGLIMG CSVTGVKPAS GDSPLQLGPK EEDVEKPVNN 301: PFSFLGRFLL GTLAAAWFVL IPIYMWIKDQ IVPKDQPI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)