AT3G60550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.522 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cyclin p3;2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
cyclin p3;2 (CYCP3;2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Negative regulatory factor PREG (InterPro:IPR012389), Cyclin-like (InterPro:IPR011028), Cyclin-related 2 (InterPro:IPR013922); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cyclin p3;1 (TAIR:AT2G45080.1); Has 1360 Blast hits to 1354 proteins in 218 species: Archae - 0; Bacteria - 18; Metazoa - 236; Fungi - 630; Plants - 217; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 259 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:22379846..22380641 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26463.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 230 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVSNSLTIS PRKLRSDLYS YSYQNNSKTP LVISVLSSLI DRTLTRNERI SRRALPSSGA GGKTQIFDCR EIPDMTIQSY LGRIFRYTKA GPSVYVVAYV 101: YIDRFCQTNP GFRISLTNVH RLLITTIMIA SKYVEDLNYR NSYFAKVGGL ETEDLNKLEL EFLFLMGFKL HVNVSVFESY CCHLEREVSF GGGYQIEKAL 201: RCAEEIKSRQ MIIQDPKHHH HHHQLARILL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)