AT3G60280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : uclacyanin 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes blue copper-binding protein III. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
uclacyanin 3 (UCC3); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, copper ion binding; LOCATED IN: anchored to membrane; EXPRESSED IN: flower; EXPRESSED DURING: petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Plastocyanin-like (InterPro:IPR003245), Cupredoxin (InterPro:IPR008972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cupredoxin superfamily protein (TAIR:AT3G60270.1); Has 71481 Blast hits to 30143 proteins in 1641 species: Archae - 182; Bacteria - 13480; Metazoa - 20867; Fungi - 8047; Plants - 12494; Viruses - 2867; Other Eukaryotes - 13544 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:22279867..22280633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22521.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 222 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSTVAAALL LFLAAVPAVF AATFKVGDIS GWTSNLDYTV WLTGKTFRVG DTLEFVYGLS HSVSVVDKAG YDNCDSSGAT QNFADGDTKI DLTTVGTMHF 101: LCPTFGHCKN GMKLAVPVLA AAPSPSTPSS PPSTPSTPSS PPSTPSTPSS PPSPPSPPSP SLPPSSLPPS ASPPTNGTPD SETLTPPPAP LPPSLSPNAA 201: SKGVMSYGII GVTMILMYAV MT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)