AT3G59730.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.946 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: carbohydrate binding, kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Legume lectin, beta chain (InterPro:IPR001220), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup (InterPro:IPR013320), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Concanavalin A-like lectin/glucanase (InterPro:IPR008985); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: lectin-receptor kinase (TAIR:AT3G59700.1); Has 116177 Blast hits to 115063 proteins in 4736 species: Archae - 93; Bacteria - 13334; Metazoa - 42710; Fungi - 10087; Plants - 32841; Viruses - 356; Other Eukaryotes - 16756 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:22064308..22065879 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59316.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 523 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFSEVKVLQI VLVQWLTLFS FTYNSHGTYI LDGSAVFNEN SYLVLTNTTK HSYGQAFDNT TFEMKDQSFS INFFFAIVPE HKQQGSHGMT FAFSPTRGLP 101: GASSDQYLGL FNKTNNGKTS NHVIAIELDI HKDEEFEDID DNHVGINING LRSVASASAG YYDDNDGSFK NLSLISGKLM RLSIVYSHPD TKLDVTLCPA 201: EFLVPPRKPL LSLNRDLSQY VLKHMHIGFT ASTGSIRALH YMVLVYTYPE AVYQPLEFGR VPTLPPYPKK PSDRLRTVLA VCLTLALFAV FLASGIGFVF 301: YLRHKKVKEV LEEWEIQCGP HRFSYKELFN ATKGFKEKQL LGKGGFGQVY KGTLPGSDAE IAVKRTSHDS RQGMSEFLAE ISTIGRLRHP NLVRLLGYCK 401: HKENLYLVYD FMPNGSLDKY LNRSNTNENQ ERLTWEQRFK IIKDVASALL HLHQEWVQVI IHRDIKPANV LIDHDMNARL GDFGLAKLYD QGFDPQTSRV 501: AGTFGYIAPE FLRTGRAVRV KFF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)