AT3G59050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : polyamine oxidase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
polyamine oxidase 3 (PAO3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Amine oxidase (InterPro:IPR002937), Flavin-containing amine oxidase (InterPro:IPR001613); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: polyamine oxidase 2 (TAIR:AT2G43020.1); Has 6641 Blast hits to 6191 proteins in 1102 species: Archae - 131; Bacteria - 2618; Metazoa - 1408; Fungi - 589; Plants - 766; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1129 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:21824932..21827173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54134.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 488 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESGGKTNRQ LRKAICVSTD EKMKKKRSPS VIVIGGGMAG ISAARTLQDA SFQVVVLESR DRIGGRVHTD YSFGFPVDLG ASWLHGVCKE NPLAAVIGRL 101: GLPLYRTSGD NSVLYDHDLE SYALFDKAGN QVSQELVTKV GENFEHILEE ICKVRDEQDE DMSIAQAFSI VFKRNPELRL EGLAHNVLQW YLCRMEGWFA 201: ADAETISAKC WDQEELLPGG HGLMVRGYRP VINTLSKGLD IRLSHRITKI SRRYSGVKVT TEKGDTFVAD AAVIALPLGV LKSGMITFEP KLPQWKQEAI 301: NDLGVGIENK IILNFDNVFW PNVEFLGVVA ETSYGCSYFL NLHKATSHPV LVYMPAGQLA RDIEKKSDEA AANFAFSQLQ KILPDASSPI NYLVSRWGSD 401: INSLGSYSYD IVNKPHDLYE RLRVPLDNLF FAGEATSSSY PGSVHGAYST GVLAAEDCRM RVLERYGELE HEMEEEAPAS VPLLISRM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)