AT3G57710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.982 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT3G57720.1); Has 42849 Blast hits to 42460 proteins in 1910 species: Archae - 26; Bacteria - 4424; Metazoa - 8022; Fungi - 1776; Plants - 24494; Viruses - 68; Other Eukaryotes - 4039 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:21386233..21387288 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40088.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 351 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKKQYLKSGS GTRKEKDKAK RWFLDNGSIF LRELVADCNG KSIPIRSFSP EQILKATNNF DSSCFVSQDV YYKWYRGEIE DRSYMIKRFS EDEITGKRHR 101: VKEVYNDIVL SARMSNHSNF LQLLGCCLEF PFPVLVFEFA EHGAMNQRGG VIVNGEESLL PWSVRLKIGK EIANAVTYLH TAFPKIIIHR DVKPMHVFLD 201: KNWTAKLSDL SFSISLPEGK SRIEAEWVLG TFGYIDPLYH KTCFVTEYTD VYSFGICLLV IITGKPAIMT ISDGDLQGIL SLVRELCENG KLDEVIDPRL 301: MKDITSGQRL QVEACVVLAL RCCKERDEDR PKMIQVAKEL KQIEASLKNS S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)