AT3G56050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase family protein (TAIR:AT2G40270.1); Has 41170 Blast hits to 40839 proteins in 1653 species: Archae - 20; Bacteria - 2328; Metazoa - 11695; Fungi - 793; Plants - 23080; Viruses - 152; Other Eukaryotes - 3102 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:20798322..20800706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55234.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.86 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 499 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSNNWKSVRL RLQNRTLVFL LVILSFGSCY SLKSQGDGFL ESVTKDLWSD IDAEDLRAVG FHRKLLGRFR NPYTHLNAFR DRPVARATPP SSSVSTRPDA 101: KRSSTLPPPQ KSPPAQHVSA PPPFVHHVTL PSLTSSSKTS SNSTIPIVAG CIAGAVFILL LATGVFFFKS KAGKSVNPWR TGLSGQLQKV FITGVPKLKR 201: SEIEAACEDF SNVIGSCPIG TLFKGTLSSG VEIAVASVAT ASAKEWTNNI EMQFRKKIEM LSKINHKNFV NLLGYCEEEE PFTRILVFEY ASNGTVFEHL 301: HYKESEHLDW VMRLRIAMGI AYCLDHMHGL KPPIVHSNLL SSSVQLTEDY AVKIADFNFG YLKGPSETES STNALIDTNI SETTQEDNVH SFGLLLFELM 401: TGKLPESVQK GDSIDTGLAV FLRGKTLREM VDPTIESFDE KIENIGEVIK SCIRADAKQR PIMKEVTGRL REITGLSPDD TIPKLSPLWW AELEVLSTA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)