AT3G54690.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.543 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Sugar isomerase (SIS) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Sugar isomerase (SIS) family protein; FUNCTIONS IN: isomerase activity, sugar binding; INVOLVED IN: carbohydrate metabolic process; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: KpsF/GutQ (InterPro:IPR004800), Sugar isomerase (SIS) (InterPro:IPR001347), Cystathionine beta-synthase, core (InterPro:IPR000644); Has 8722 Blast hits to 8719 proteins in 1857 species: Archae - 184; Bacteria - 5776; Metazoa - 15; Fungi - 131; Plants - 43; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 2571 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:20246586..20247810 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37750.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 350 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSLPPPSLD FSSIDHNSLK NGGSSHQEIS HDNLLNLFKS QQDLLNHFFK HLDLSQTLDF SRILLSTTGT VFFTGVGKSA FVANKVSQTL VSLSFRSSFL 101: SPLDALHGDI GALSPRDVLV FFSKSGATEE LLRLVPCARA KGAFLVSLTS VSGNPLAGVC DMNVHLPLQR ELCPFNLAPV TSTAIQMVFG DTIAVALMAA 201: RNLSKEEYAA NHPAGRIGKS LIFKVKDVMK KQEELPVCKE GDLIMDQLVE LTSKGCGCLL VVDEHSRLIG TFTDGDLRRT LKASGEAIFK LSVGEMCNRK 301: PRTIGPETMA VEAMKKMESP PSPVQFLPVV NEDNTLIGIV TLHGLVSAGL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)