AT3G53150.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-glucosyl transferase 73D1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
UDP-glucosyl transferase 73D1 (UGT73D1); FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring hexosyl groups, UDP-glycosyltransferase activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: stem, sepal, stamen; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: don-glucosyltransferase 1 (TAIR:AT2G36800.1); Has 7415 Blast hits to 7339 proteins in 377 species: Archae - 0; Bacteria - 180; Metazoa - 2057; Fungi - 21; Plants - 5064; Viruses - 36; Other Eukaryotes - 57 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:19697736..19699259 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57453.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 507 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESKIVSKAK RLHFVLIPLM AQGHLIPMVD ISKILARQGN IVTIVTTPQN ASRFAKTVDR ARLESGLEIN VVKFPIPYKE FGLPKDCETL DTLPSKDLLR 101: RFYDAVDKLQ EPMERFLEQQ DIPPSCIISD KCLFWTSRTA KRFKIPRIVF HGMCCFSLLS SHNIHLHSPH LSVSSAVEPF PIPGMPHRIE IARAQLPGAF 201: EKLANMDDVR EKMRESESEA FGVIVNSFQE LEPGYAEAYA EAINKKVWFV GPVSLCNDRM ADLFDRGSNG NIAISETECL QFLDSMRPRS VLYVSLGSLC 301: RLIPNQLIEL GLGLEESGKP FIWVIKTEEK HMIELDEWLK RENFEERVRG RGIVIKGWSP QAMILSHGST GGFLTHCGWN STIEAICFGV PMITWPLFAE 401: QFLNEKLIVE VLNIGVRVGV EIPVRWGDEE RLGVLVKKPS VVKAIKLLMD QDCQRVDEND DDNEFVRRRR RIQELAVMAK KAVEEKGSSS INVSILIQDV 501: LEQLSLV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)