AT3G52200.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Dihydrolipoamide acetyltransferase, long form protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
dihydrolipoamide S-acetyltransferase (LTA3) mRNA, nuclear | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
LTA3; FUNCTIONS IN: dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase activity, ATP binding; INVOLVED IN: pyruvate metabolic process, metabolic process, acetyl-CoA biosynthetic process from pyruvate; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 2-oxo acid dehydrogenase, lipoyl-binding site (InterPro:IPR003016), Dihydrolipoamide acetyltransferase, long form (InterPro:IPR006257), E3 binding (InterPro:IPR004167), 2-oxoacid dehydrogenase acyltransferase, catalytic domain (InterPro:IPR001078), Single hybrid motif (InterPro:IPR011053), Biotin/lipoyl attachment (InterPro:IPR000089); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Dihydrolipoamide acetyltransferase, long form protein (TAIR:AT1G54220.2); Has 31247 Blast hits to 19646 proteins in 2349 species: Archae - 188; Bacteria - 18229; Metazoa - 1059; Fungi - 783; Plants - 619; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 10369 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:19360317..19366091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 68866.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 637 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVLPLFRRAA IARTSSLLRA RLFAPASEFH SRFSNGLYHL DDKISSSNGV RSASIDLITR MDDSSPKPIL RFGVQNFSST GPISQTVLAM PALSPTMSHG 101: NVVKWMKKEG DKVEVGDVLC EIETDKATVE FESQEEGFLA KILVTEGSKD IPVNEPIAIM VEEEDDIKNV PATIEGGRDG KEETSAHQVM KPDESTQQKS 201: SIQPDASDLP PHVVLEMPAL SPTMNQGNIA KWWKKEGDKI EVGDVIGEIE TDKATLEFES LEEGYLAKIL IPEGSKDVAV GKPIALIVED AESIEAIKSS 301: SAGSSEVDTV KEVPDSVVDK PTERKAGFTK ISPAAKLLIL EHGLEASSIE ASGPYGTLLK SDVVAAIASG KASKSSASTK KKQPSKETPS KSSSTSKPSV 401: TQSDNNYEDF PNSQIRKIIA KRLLESKQKI PHLYLQSDVV LDPLLAFRKE LQENHGVKVS VNDIVIKAVA VALRNVRQAN AFWDAEKGDI VMCDSVDISI 501: AVATEKGLMT PIIKNADQKS ISAISLEVKE LAQKARSGKL APHEFQGGTF SISNLGMYPV DNFCAIINPP QAGILAVGRG NKVVEPVIGL DGIEKPSVVT 601: KMNVTLSADH RIFDGQVGAS FMSELRSNFE DVRRLLL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)