AT3G51970.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.931 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : acyl-CoA sterol acyl transferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
acyl-CoA sterol acyl transferase 1 (ASAT1); FUNCTIONS IN: acyltransferase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 10 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Wax synthase (InterPro:IPR017088); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MBOAT (membrane bound O-acyl transferase) family protein (TAIR:AT5G55350.1); Has 801 Blast hits to 791 proteins in 235 species: Archae - 0; Bacteria - 473; Metazoa - 0; Fungi - 36; Plants - 238; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 54 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:19284420..19285457 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39322.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 345 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASFIKAWGL VIISLCYTFF IAKLVPKGIK RLILFFPVFL IFFIVPFLIY SLHLLGITAF FIAWLANFKL LLFALGRGPL SSNHKPLSLP IFLAVSCLPI 101: KIQLSPKPTK THSHEGSTEG PLIYTIKAVF VVLIIKAYEY STKLPEKVVL TLYAIHIYFA LEIILAATAA AVRAMSDLEL EPQFNKPYLA TSLQDFWGRR 201: WNLMVTGILR PTVYEPSLQL FSVLGPNYSQ ILAAFGTFVV SGIMHELIFF YMGRLRPDWK MMWFFLINGF CTTVEIAIKK TINGRWRFPK AISQVLTLTF 301: VMVTALWLFL PEFNRCNIVE KALDEYAAIG AFAVEVRRKL TAYLF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)