AT3G51820.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UbiA prenyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with chlorophyll synthase activity. This enzyme has been shown to perform the esterification of chlorophyllide (a and b), the last step of chlorophyll biosynthesis. Although it can use either geranylgeranyl pyrophosphate (GGPP) or phytyl pyrophosphate (PhyPP) as substrates, the esterification reaction was faster with GGPP than with PhyPP. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
G4; FUNCTIONS IN: chlorophyll synthetase activity; INVOLVED IN: chlorophyll biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, chloroplast; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase (InterPro:IPR006372), Chlorophyll synthase, ChlG (InterPro:IPR011799), UbiA prenyltransferase (InterPro:IPR000537); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: homogentisate prenyltransferase (TAIR:AT3G11945.1); Has 2782 Blast hits to 2782 proteins in 800 species: Archae - 310; Bacteria - 1584; Metazoa - 63; Fungi - 24; Plants - 236; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 565 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:19216301..19218934 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41883.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 387 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTSILNTVST IHSSRVTSVD RVGVLSLRNS DSVEFTRRRS GFSTLIYESP GRRFVVRAAE TDTDKVKSQT PDKAPAGGSS INQLLGIKGA SQETNKWKIR 101: LQLTKPVTWP PLVWGVVCGA AASGNFHWTP EDVAKSILCM MMSGPCLTGY TQTINDWYDR DIDAINEPYR PIPSGAISEP EVITQVWVLL LGGLGIAGIL 201: DVWAGHTTPT VFYLALGGSL LSYIYSAPPL KLKQNGWVGN FALGASYISL PWWAGQALFG TLTPDVVVLT LLYSIAGLGI AIVNDFKSVE GDRALGLQSL 301: PVAFGTETAK WICVGAIDIT QLSVAGYLLA SGKPYYALAL VALIIPQIVF QFKYFLKDPV KYDVKYQASA QPFLVLGIFV TALASQH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)