AT3G50480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.994 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : homolog of RPW8 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Homolog of RPW8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
homolog of RPW8 4 (HR4); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: response to other organism; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Powdery mildew resistance protein, RPW8 domain (InterPro:IPR008808); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: homolog of RPW8 3 (TAIR:AT3G50470.1); Has 106 Blast hits to 90 proteins in 15 species: Archae - 14; Bacteria - 4; Metazoa - 2; Fungi - 0; Plants - 72; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 14 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:18733287..18734180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23390.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 200 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPIAELAVIK TVGGPLIAAA LGVGAQVIYD GFRKGKDTSI INRLGRTMES ISPVRDRIGK LSNVEGKPFR EVHESLTRLL EDAKSIIEKY WKLRWSRHVC 101: RKYRYIKKLE SIELELVRVA REIQVHQWTD IKEMKAIQVH QWTDIKEMKA IQVDQWTDIK EMKAIQVDQW IDIKEMKAIQ VDQWTDIKEM KAQISEKHNK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)