AT3G48700.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : carboxyesterase 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
carboxyesterase 13 (CXE13); FUNCTIONS IN: hydrolase activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 6 plant structures; EXPRESSED DURING: F mature embryo stage, petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lipase, GDXG, active site (InterPro:IPR002168), Alpha/beta hydrolase fold-3 (InterPro:IPR013094); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha/beta-Hydrolases superfamily protein (TAIR:AT3G48690.1); Has 10327 Blast hits to 10297 proteins in 1570 species: Archae - 114; Bacteria - 5663; Metazoa - 1261; Fungi - 886; Plants - 1402; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 998 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:18038825..18039814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36101.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 329 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDSEIAADYS PMLIIYKSGR IERLVGETTV PPSSNPQNGV VSKDVVYSPD NNLSLRIYLP EKAATAETEA SVKLPLLVYF HGGGFLVETA FSPTYHTFLT 101: AAVSASDCVA VSVDYRRAPE HPIPTSYDDS WTALKWVFSH IAGSGSEDWL NKHADFSKVF LAGDSAGANI THHMTMKAAK DKLSPESLNE SGISGIILVH 201: PYFWSKTPVD DKETTDVAIR TWIESVWTLA SPNSKDGSDD PFINVVQSES VDLSGLGCGK VLVMVAEKDA LVRQGWGYWE KLGKSRWNGE VLDVVETKGE 301: GHVFHLRDPN SEKAHELVHR FAGFIKGDK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)