AT3G48040.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : RHO-related protein from plants 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the Rop subfamily of Rho GTPases in Arabidopsis that contains a putative farnesylation motif. It is localized to the plasma membrane and involved in the negative regulation of ABA signalling. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
RHO-related protein from plants 10 (ROP10); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ras GTPase (InterPro:IPR001806), Small GTP-binding protein (InterPro:IPR005225), Ras (InterPro:IPR013753), Small GTPase, Rho type (InterPro:IPR003578); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RAC-like 10 (TAIR:AT5G62880.1); Has 24141 Blast hits to 24113 proteins in 664 species: Archae - 8; Bacteria - 48; Metazoa - 12688; Fungi - 3443; Plants - 2679; Viruses - 20; Other Eukaryotes - 5255 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:17731561..17733241 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23069.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 208 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASSASKFIK CVTVGDGAVG KTCMLICYTS NKFPTDYIPT VFDNFSVNVV VEGITVNLGL WDTAGQEDYN RLRPLSYRGA DVFVLAFSLI SRASYENVFK 101: KWIPELQHFA PGVPIVLVGT KMDLREDRHY LSDHPGLSPV TTSQGEELRK HIGATYYIEC SSKTQQNVKA VFDAAIKVVI KPAVKQKEKK KKQKPRSGCL 201: SNILCGKN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)