AT3G47930.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
L-Galactono-1,4-lactone dehydrogenase, catalyzes the final step of ascorbate biosynthesis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase (GLDH); FUNCTIONS IN: galactonolactone dehydrogenase activity, L-gulono-1,4-lactone dehydrogenase activity; INVOLVED IN: L-ascorbic acid biosynthetic process; LOCATED IN: mitochondrion, plastid; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: D-arabinono-1,4-lactone oxidase (InterPro:IPR007173), FAD-binding, type 2 (InterPro:IPR016166), Galactonolactone dehydrogenase (InterPro:IPR010029), Actin-binding FH2 (InterPro:IPR015425), FAD linked oxidase, N-terminal (InterPro:IPR006094); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: D-arabinono-1,4-lactone oxidase family protein (TAIR:AT5G56490.1); Has 6177 Blast hits to 6159 proteins in 1453 species: Archae - 118; Bacteria - 3787; Metazoa - 393; Fungi - 445; Plants - 381; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1050 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:17684500..17687426 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 68558.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 610 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLRSLLLRRS VGHSLGTLSP SSSTIRSSFS PHRTLCTTGQ TLTPPPPPPP RPPPPPPATA SEAQFRKYAG YAALAIFSGV ATYFSFPFPE NAKHKKAQIF 101: RYAPLPEDLH TVSNWSGTHE VQTRNFNQPE NLADLEALVK ESHEKKLRIR PVGSGLSPNG IGLSRSGMVN LALMDKVLEV DKEKKRVTVQ AGIRVQQLVD 201: AIKDYGLTLQ NFASIREQQI GGIIQVGAHG TGARLPPIDE QVISMKLVTP AKGTIELSRE KDPELFHLAR CGLGGLGVVA EVTLQCVARH ELVEHTYVSN 301: LQEIKKNHKK LLSANKHVKY LYIPYTDTVV VVTCNPVSKW SGPPKDKPKY TTDEAVQHVR DLYRESIVKY RVQDSGKKSP DSSEPDIQEL SFTELRDKLL 401: ALDPLNDVHV AKVNQAEAEF WKKSEGYRVG WSDEILGFDC GGQQWVSESC FPAGTLANPS MKDLEYIEEL KKLIEKEAIP APAPIEQRWT ARSKSPISPA 501: FSTSEDDIFS WVGIIMYLPT ADPRQRKDIT DEFFHYRHLT QKQLWDQFSA YEHWAKIEIP KDKEELEALQ ARIRKRFPVD AYNKARRELD PNRILSNNMV 601: EKLFPVSTTA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)