AT3G47810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.490 cytosol 0.471 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Homolog of yeast retromer subunit VPS29. Part of a retromer-like protein complex involved in endosome to lysosome protein transport. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MAIGO 1 (MAG1); FUNCTIONS IN: hydrolase activity, acting on ester bonds, protein serine/threonine phosphatase activity; INVOLVED IN: endosome to lysosome transport, protein targeting to vacuole; LOCATED IN: microsome, retromer complex, membrane, multivesicular body; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphodiesterase MJ0936 (InterPro:IPR000979); Has 1298 Blast hits to 1264 proteins in 597 species: Archae - 104; Bacteria - 671; Metazoa - 203; Fungi - 159; Plants - 64; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 97 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:17637256..17639017 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20969.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 190 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVLVLALGDL HVPHRAADLP PKFKSMLVPG KIQHIICTGN LCIKEIHDYL KTICPDLHIV RGEFDEDARY PENKTLTIGQ FKLGLCHGHQ VIPWGDLDSL 101: AMLQRQLGVD ILVTGHTHQF TAYKHEGGVV INPGSATGAY SSINQDVNPS FVLMDIDGFR AVVYVYELID GEVKVDKIEF KKPPTTSSGP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)