AT3G46340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: hypocotyl, flower, pedicel; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT3G46400.1); Has 163065 Blast hits to 121532 proteins in 4648 species: Archae - 95; Bacteria - 13859; Metazoa - 44066; Fungi - 9550; Plants - 76922; Viruses - 348; Other Eukaryotes - 18225 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:17026658..17031842 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 99558.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 889 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEFPHSVLLV VLIIATFAIS NLVQAEEDQE GFISLDCGLP PNEVSPYIEP FTGLRFSSDS SFIQSGKIGK VDKSFEATTL KSYMTLRYFP DGKRNCYNLI 101: VKQGKTYMIR ATALYGNYDG LNISPKFDLY IGANFWTTLD AGEYLSGVVE EVNYIPRSNS LDVCLVKTDT STPFLSLLEL RPLDNDSYLT GSGSLKTFRR 201: YYLSNSESVI AYPEDVKDRI WEPTFDSEWK QIWTTLKPNN SNGYLVPKNV LMTAAIPAND SAPFRFTEEL DSPTDELYVY LHFSEVQSLQ ANESREFDIL 301: WSGEVAYEAF IPEYLNITTI QTNTPVTCPG GKCNLELKRT KNSTHPPLIN AIEFYTVVNF PQLETNETDV VAIKDIKATY ELNRITWQGD PCVPQKFIWE 401: GLDCNSKDAL TLPRITSLNL SSTGLTGNIA AGIQNLTHLD KLDLSNNNLT GGVPEFLASM KSLSFINLSK NNLNGSIPQA LLKREKDGLK LSVDEQIRCF 501: PGSCVITKKK FPVMIVALVS SAVVVILVVL VLIFVFKKKK PSNLEDLPPS SNTPRENITS TSISDTSIET KRKRFSYSEV MEMTKNLQRP LGEGGFGVVY 601: HGDINGSSQQ VAVKLLSQSS TQGYKEFKAE VELLLRVHHI NLVSLVGYCD ERDHLALIYE YMSNKDLKHH LSGKHGGSVL KWNTRLQIAV DAALGLEYLH 701: IGCRPSMVHR DVKSTNILLD DQFTAKMADF GLSRSFQLGD ESQVSTVVAG TPGYLDPEYY RTGRLAEMSD VYSFGIVLLE IITNQRVIDP AREKSHITEW 801: TAFMLNRGDI TRIMDPNLQG DYNSRSVWRA LELAMMCANP SSEKRPSMSQ VVIELKECIR SENKTQGMDS HSSFEQSMSF DTKAVPSAR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)