AT3G46200.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.996 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nudix hydrolase homolog 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nudix hydrolase homolog 9 (NUDT9); FUNCTIONS IN: hydrolase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cytosol; EXPRESSED IN: 15 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NUDIX hydrolase domain-like (InterPro:IPR015797), NUDIX hydrolase domain (InterPro:IPR000086); Has 111 Blast hits to 111 proteins in 48 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 56; Fungi - 0; Plants - 40; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 15 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:16969283..16971017 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34718.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 311 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKLAEEMNP EGSRYQLLLS CPSGLSPSQV SVDFSKSHDR IPRQDPGLED SISQVWEQRS QGNSSLFNGQ KFRYGGYCLD DDDGSTNEVP HVCLRLGLTD 101: YRTFVGTNLS SLWEKFLVTS EDDSVRCRHT SSPLGNGAVI ETSDKKIIVL RRSNNVGEFP GHYVFPGGHP EPTAVGIDYH QLENNVQTGE VLNKKVTQEM 201: FDSIICEVVE ETGIPASSLS SPLFIGISRR ELNVRPAMFF YLKCSHHSDD IQRLYSSAED GFESTQLHTV SLDELKMMTS RMPGCHHGGF ALYELMLQRL 301: KNTKETSLIA T |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)