AT3G45770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Polyketide synthase, enoylreductase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Polyketide synthase, enoylreductase family protein; FUNCTIONS IN: copper ion binding, zinc ion binding, ATP binding; INVOLVED IN: oxidation reduction, metabolic process; LOCATED IN: mitochondrion, chloroplast, nucleus; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GroES-like (InterPro:IPR011032), Polyketide synthase, enoylreductase (InterPro:IPR020843), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Alcohol dehydrogenase GroES-like (InterPro:IPR013154), Alcohol dehydrogenase, C-terminal (InterPro:IPR013149), Alcohol dehydrogenase superfamily, zinc-containing (InterPro:IPR002085); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ARP protein (REF) (TAIR:AT1G49670.1); Has 24073 Blast hits to 23997 proteins in 2260 species: Archae - 304; Bacteria - 15447; Metazoa - 1396; Fungi - 2050; Plants - 679; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4197 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:16805753..16807774 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40825.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 375 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAALMESVVG RALKFSSTAN FRSIRRGETP TLCIKSFSTI MSPPSKAIVY EEHGSPDSVT RLVNLPPVEV KENDVCVKMI AAPINPSDIN RIEGVYPVRP 101: PVPAVGGYEG VGEVYAVGSN VNGFSPGDWV IPSPPSSGTW QTYVVKEESV WHKIDKECPM EYAATITVNP LTALRMLEDF VNLNSGDSVV QNGATSIVGQ 201: CVIQLARLRG ISTINLIRDR AGSDEAREQL KALGADEVFS ESQLNVKNVK SLLGNLPEPA LGFNCVGGNA ASLVLKYLRE GGTMVTYGGM SKKPITVSTT 301: SFIFKDLALR GFWLQSWLSM GKVKECREMI DYLLGLARDG KLKYETELVP FEEFPVALDK ALGKLGRQPK QVITF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)