AT3G44720.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : arogenate dehydratase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a plastid-localized arogenate dehydratase involved in phenylalanine biosynthesis. Not less than six genes encoding ADT were identified in the Arabidopsis genome: ADT1 [At1g11790]; ADT2 [At3g07630]; ADT3 [At2g27820]; ADT4 [At3g44720]; ADT5 [At5g22630]; and ADT6 [At1g08250]. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
arogenate dehydratase 4 (ADT4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Prephenate dehydratase (InterPro:IPR001086), Prephenate dehydratase, conserved site (InterPro:IPR018528); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: arogenate dehydratase 5 (TAIR:AT5G22630.1); Has 7069 Blast hits to 7066 proteins in 2218 species: Archae - 179; Bacteria - 3950; Metazoa - 0; Fungi - 120; Plants - 261; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2559 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:16271759..16273033 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45927.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 424 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQAATSCDLK FRSTDPTSRN KCFSHAIPKR VAVTCGYRSE SFSFPNGVSV SRSDWQSSCA ILSSKVASVE NTGGLADKIA AVNGHTNGSV NLGLVAVEST 101: NGKLAPAQPL TITDLSPAPL HGSSLRVAYQ GVPGAYSEAA AGKAYPNCDA IPCDQFDVAF QAVELWIADR AVLPVENSLG GSIHRNYDLL LRHRLHIVGE 201: VQIPVHHCLL ALPGVRTDCV SRVISHPQAL AQTEHSLDVL TPHAAREAFH DTAAAAEYIS ANDLHDTAAV ASARAAELYN LQILADGIQD DPGNVTRFLM 301: LAREPIIPRT DRPFKTSIVF AAQEHKGTSV LFKVLSAFAF RDISLTKIES RPHHNRPLRV VGDGSFGTSK NFEYMFYVDF EASMAEPRAQ NALAEVQEYT 401: SFLRVLGSYP MDMTPWSMTS TEEA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)