AT3G42050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.500 vacuole 0.500 ASURE: golgi,vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : vacuolar ATP synthase subunit H family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
vacuolar ATP synthase subunit H family protein; FUNCTIONS IN: binding, hydrolase activity, acting on acid anhydrides, catalyzing transmembrane movement of substances, proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism; INVOLVED IN: ATP synthesis coupled proton transport; LOCATED IN: vacuolar membrane, chloroplast, plasma membrane, vacuole, plant-type vacuole; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, V1 complex, subunit H (InterPro:IPR004908), ATPase, V1 complex, subunit H, C-terminal (InterPro:IPR011987), Armadillo-like helical (InterPro:IPR011989), Armadillo-type fold (InterPro:IPR016024); Has 505 Blast hits to 479 proteins in 224 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 202; Fungi - 135; Plants - 70; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 98 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:14228846..14232228 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50287.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 441 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDQAELSIEQ VLKRDIPWET YMNTKLVSAK GLQLLRRYDK KPESARAQLL DEDGPAYVHL FVSILRDIFK EETVEYVLAL IYEMLSANPT RARLFHDESL 101: ANEDTYEPFL RLLWKGNWFI QEKSCKILAW IISARPKAGN AVIGNGIDDV LKGLVEWLCA QLKQPSHPTR GVPIAISCLS SLLKEPVVRS SFVQADGVKL 201: LVPLISPAST QQSIQLLYET CLCIWLLSYY EPAIEYLATS RTMQRLTEVV KHSTKEKVVR VVILTFRNLL PKGTFGAQMV DLGLPHIIHS LKTQAWSDED 301: LLDALNQLEE GLKDKIKKLS SFDKYKQEVL LGHLDWNPMH KETNFWRENV TCFEENDFQI LRVLLTILDT SSDPRSLAVA CFDISQFIQY HAAGRVIVAD 401: LKAKERVMKL INHENAEVTK NAILCIQRLL LGAKYASFLQ A |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)