AT3G29575.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ABI five binding protein 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ABI five binding protein 3 (AFP3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF1675 (InterPro:IPR012463); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ABI five binding protein (TAIR:AT1G69260.1); Has 196 Blast hits to 190 proteins in 23 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 2; Fungi - 4; Plants - 184; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:11382416..11383657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25244.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 231 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSKKQRLSEE DGEVEIELDL GLSLNGRFGV DPLAKTRLMR STSVLDLVVN DRSGLSRTCS LPVETEEEWR KRKELQSLRR LEAKRKRSEK QRKHKACGGE 101: EKVVEEGSIG SSGSGSSGLS EVDTLLPPVQ ATTNKSVETS PSSAQSQPEN LGKEASQNII EDMPFVSTTG DGPNGKKING FLYRYRKGEE VRIVCVCHGS 201: FLSPAEFVKH AGGGDVAHPL KHIVVNPSPF L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)