AT3G29430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Terpenoid synthases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Terpenoid synthases superfamily protein; INVOLVED IN: isoprenoid biosynthetic process; EXPRESSED IN: root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Polyprenyl synthetase-related (InterPro:IPR017446), Terpenoid synthase (InterPro:IPR008949), Polyprenyl synthetase (InterPro:IPR000092); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Terpenoid synthases superfamily protein (TAIR:AT3G32040.1); Has 16721 Blast hits to 16714 proteins in 2936 species: Archae - 341; Bacteria - 9398; Metazoa - 333; Fungi - 416; Plants - 457; Viruses - 12; Other Eukaryotes - 5764 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:11311427..11312604 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38504.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.94 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 357 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATTLSSSSL FIQFRGRRYN SLSSFNNLQK RTVLSLSCAL SSQGGDMIPP EGKSNDRNSA FDFKSYMIRK AESVSAALNV SVPLQEPLTI QEAVRYSLLA 101: GGKRVRPLLC IAACELVGGD EATAMSAACA VEMIHTSSLI HDDLPCMDDA DLRRGKPTNH KEFGEDMAVL AGDALLALAF EHMTFVSNGL VAPERMIRAV 201: MELAKAIGTK GLVAGQVTDL CSQGLNPDDV GLERLEFIHL HKTAALLEAA AVLGAIMGGG TEEEIEKLRK YARCIGLLFQ VVDDILDVTE STKELGKTAG 301: KDVMAGKLTY PRLIGLERSR EVAEKLRREA AEQLLGFDSD KAAPLVALAS YIACRHN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)