AT3G27890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NADPH:quinone oxidoreductase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes NAD(P)H:quinone reductase which is an FMN binding protein that catalyzes the reduction of quinone substrates to hydroquinones.The enzyme activity was confirmed by in vitro assay. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NADPH:quinone oxidoreductase (NQR); FUNCTIONS IN: FMN reductase activity; INVOLVED IN: response to salt stress, defense response to bacterium; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast, plasma membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NADPH-dependent FMN reductase (InterPro:IPR005025); Has 4868 Blast hits to 4868 proteins in 1478 species: Archae - 69; Bacteria - 4415; Metazoa - 6; Fungi - 46; Plants - 72; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 260 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:10350807..10351938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21557.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 196 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEAVTAIKPL IRVAALSGSL RKTSFHTGLL RAAIDLTKES VPGLQIEYID ISPLPLINTD LEVNGTYPPV VEAFRQKILE ADSILFASPE YNFSVSAPLK 101: NALDWASRPP NVWADKPAAI ISTGGGFGGG RSQYHLRQIG VFLDLHFINK PEFTLNAFQP PQKFDAEGNL VDEVTKERLK QVLLSLQAFT LRLQGK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)