AT3G27580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.854 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
a member of a subfamily of Ser/Thr PKs in plants. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATPK7; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: D6 protein kinase like 2 (TAIR:AT5G47750.1); Has 118014 Blast hits to 91974 proteins in 2859 species: Archae - 52; Bacteria - 14000; Metazoa - 46533; Fungi - 13234; Plants - 22437; Viruses - 379; Other Eukaryotes - 21379 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:10217671..10219484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64289.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 578 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDSSSSVVYV GSSSKSRNFQ SKSKGSITSF SIDSRGTKKS MKTLLIPEPE PTSPEVIESS VSSVSAESET PISIIRKKKQ SEPRFYSSPT NTFYTEAKQS 101: FTNTEFSECA SISTIGIGGI DLEKNGVMIY RGSIGSDVSD ESSSSGLSNA AYKPHRDNND KRWVAIQEVR SRVGSSLEAK DFKLIKKLGG GDIGNVYLAE 201: LIGTGVSFAV KVMEKAAIAA RKKLVRAQTE KEILQSLDHP FLPTLYSHFE TEMNSCLVME FCPGGDLHSL RQKQRGKYFP EQAARFYVAE VLLAMEYLHM 301: LGIIYRDLKP ENVLVREDGH IMLSDFDLSL RCAVSPTLVR FAAITLESKS SSYCIQPTCV DQSSCIVQPD CIQPVCFTPR FLSKGKHRKK SNDMSRQIRP 401: LPELIAEPTS ARSMSFVGTH EYLAPEIIKG EGHGSAVDWW TFGIFLYELL FGITPFRGGD NRATLFNVVG QPLRFPEHPN VSFAARDLIR GLLVKEPQHR 501: LAYRRGATEI KQHPFFQSVN WALIRCTSPP QIPQPVKPMD QAHSVRHGFS QGHGHVGYDK PPTVDVKPSG NYLEIDFF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)