AT3G27300.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glucose-6-phosphate dehydrogenase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
glucose-6-phosphate dehydrogenase 5 (G6PD5); FUNCTIONS IN: glucose-6-phosphate dehydrogenase activity; INVOLVED IN: response to cadmium ion, pentose-phosphate shunt, oxidative branch, glucose metabolic process; LOCATED IN: cytosol, chloroplast; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glucose-6-phosphate dehydrogenase, active site (InterPro:IPR019796), Glucose-6-phosphate dehydrogenase, C-terminal (InterPro:IPR022675), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Glucose-6-phosphate dehydrogenase (InterPro:IPR001282), Glucose-6-phosphate dehydrogenase, NAD-binding (InterPro:IPR022674); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glucose-6-phosphate dehydrogenase 6 (TAIR:AT5G40760.1); Has 8384 Blast hits to 8367 proteins in 2341 species: Archae - 0; Bacteria - 5762; Metazoa - 904; Fungi - 180; Plants - 377; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 1157 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:10083318..10086288 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59160.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 516 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSGQWHMEK RSTLKNDSFV KEYNPVTETG SLSIIVLGAS GDLAKKKTFP ALFNLFHQGF LNPDEVHIFG YARSKITDEE LRDKIRGYLV DEKNASKKTE 101: ALSKFLKLIK YVSGPYDSEE GFKRLDKAIL EHEISKKTAE GSSRRLFYLA LPPSVYPPVS KMIKAWCTNK SDLGGWTRIV VEKPFGKDLE SAEQLSSQIG 201: ALFEEPQIYR IDHYLGKELV QNMLVLRFAN RLFLPLWNRD NIANVQIVFR EDFGTEGRGG YFDEYGIIRD IIQNHLLQVL CLVAMEKPIS LKPEHIRDEK 301: VKVLQSVIPI KDEEVVLGQY EGYRDDPTVP NDSNTPTFAT TILRINNERW EGVPFILKAG KAMSSKKADI RIQFKDVPGD IFKCQNQGRN EFVIRLQPSE 401: AMYMKLTVKQ PGLEMQTVQS ELDLSYKQRY QDVSIPEAYE RLILDTIRGD QQHFVRRDEL KAAWEIFTPL LHRIDKGEVK SVPYKQGSRG PAEADQLLKK 501: AGYMQTHGYI WIPPTL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)