AT3G26890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G41110.1); Has 393 Blast hits to 383 proteins in 134 species: Archae - 0; Bacteria - 61; Metazoa - 171; Fungi - 74; Plants - 80; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 7 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:9907456..9910463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 70597.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 649 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGLPQTASSE QSQEALSTPS CSLSQSLPVY ATSHDSDVLN SGSEEGICSS IAEFDRKTSL EPLEFTDDSC RFRGTCVVTS SSAHGSTSYA AGKVSSSLTG 101: ARRIVGFASG ETSSLDNKQT SVAVDHSLSS TVGVAGVDIG GALVRKRVLS PLNTLFPVKF RGDLHDISCG NHQQITYSGQ SNGFCNSVAQ DHIKANTPSR 201: LHLSTTPTTT SCWEWKNVSN SGRLSSMVFT DGPLLDSVDL RQPVKGGEVC LYSPLYETSS TPNKPLPCDK EISVSPPLCL SPLGPKFSER VKAVRSCQTG 301: KILEDLRNIS EEAELRVDRR LFDDAYAIRR AFSMERSTES APASPCKRFI RSLSGRPIQR SLVGSFEESL LTGRLSCGPT NQKIDGFLAV LSIAGGNISP 401: KSQKLPFSVT SAGDDCLLLY YASIDLAGGS KLNKFWGQKV KTSQMNSDAQ SSKSQLRIPM KGRIQLVLSN PEKTPLHTFL CNYDLTDMPA GTKTFLRQKV 501: TLGSSNPTSE ATQENTRKAT SLEKENSKHG DKESCEGSDS VDSVEGDVLH ESGKICLKPS KECNGGSGAL RYALHLRFLC PLPKKSSKKS EETESTGQKK 601: NLDSDGKRRF YLYNDLRVVF PQRHTDSDEG KLNVEYHYPE NPRYFDITE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)