AT3G26090.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : G-protein coupled receptors;GTPase activators | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes AtRGS1, a putative membrane receptor for D-glucose. Also functions as a regulator of G-protein signaling. Has GTPase-accelerating activity. Regulates the activity of AtGPA1. Lines over-expressing the gene are more tolerant to dehydration and root elongation. These phenotypes are dependent on ABA. Nuclear localization of the protein is dependent on ABA. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
REGULATOR OF G-PROTEIN SIGNALING 1 (RGS1); FUNCTIONS IN: G-protein coupled receptor activity, GTPase activator activity; INVOLVED IN: in 6 processes; LOCATED IN: nucleus, plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Regulator of G protein signalling superfamily (InterPro:IPR016137), Regulator of G protein signalling (InterPro:IPR000342); Has 59 Blast hits to 59 proteins in 16 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 9; Fungi - 0; Plants - 16; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 34 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:9532883..9535410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52949.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 459 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASGCALHGG CPSDYVAVAI SVICFFVLLS RSVLPCLIHK APRTNSSSFW IPVIQVISSF NLLFSIMMSV NLLRFRTKHW WRYCYLWAVW IEGPLGFGLL 101: MSCRITQAFQ LYFIFVKKRL PPVKSYIFLP LVLLPWIFGA AIIHATKPLN DKCHMGLQWT FPVAGLHALY VLALIAFTRA VRHVEFRFDE LRDLWKGILV 201: SATSIVIWVT AFVLNEIHEE ISWLQVASRF VLLVTGGILV VVFFSISSNQ PLLSQISLKK RQNFEFQRMG QALGIPDSGL LFRKEEFRPV DPNEPLDKLL 301: LNKRFRHSFM EFADSCYAGE TLHFFEEVYE HGKIPEDDSI RRIYMARHIM EKFIVAGAEM ELNLSHKTRQ EILTTQDLTH TDLFKNALNE VMQLIKMNLV 401: RDYWSSIYFI KFKEEESCHE AMHKEGYSFS SPRLSSVQGS DDPFYQEHMS KSSRCSSPG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)