AT3G25610.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATPase E1-E2 type family protein / haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ATPase E1-E2 type family protein / haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein; FUNCTIONS IN: ATPase activity, coupled to transmembrane movement of ions, phosphorylative mechanism; INVOLVED IN: phospholipid transport, ATP biosynthetic process; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 12 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, P-type, phospholipid-translocating, flippase (InterPro:IPR006539), ATPase, P-type, ATPase-associated domain (InterPro:IPR008250), ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter (InterPro:IPR001757), ATPase, P-type phosphorylation site (InterPro:IPR018303); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: autoinhibited Ca2+/ATPase II (TAIR:AT1G13210.1); Has 13604 Blast hits to 12205 proteins in 1686 species: Archae - 149; Bacteria - 4503; Metazoa - 3227; Fungi - 2074; Plants - 1200; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 2448 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:9308942..9313353 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 136287.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1202 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MAGPSRRRRR LHLSKIYSYT CGKSSFQEDH SNIGGPGFSR VVYCNEPGSP AAERRNYAGN YVRSTKYTVA SFFPKSLFEQ FRRVANFYFL VTGILSLTDL 0101: SPYGAVSALL PLALVISATM VKEGIEDWRR KQQDIEVNNR KVKVHDGNGI FRQEEWRNLR VGDIVRVEKD EFFPADLLLL SSSYEDSVCY VETMNLDGET 0201: NLKVKQGLEA TSSLLNQDSD FKDFRGVVRC EDPNVNLYVF VGTLALEEER FPLSIQQILL RDSKLRNTEY VYGAVVFTGH DTKVIQNSTD PPSKRSRIER 0301: TMDKIIYLMF GLVFLMSFVG SIIFGVETRE DKVKNGRTER WYLKPDDADI FFDPERAPMA AIYHFFTATM LYSYFIPISL YVSIEIVKVL QSIFINRDIH 0401: MYYEETDKPA QARTSNLNEE LGMVDTILSD KTGTLTCNSM EFIKCSIAGK AYGRGITEVE RAMAVRSGGS PLVNEDLDVV VDQSGPKVKG FNFEDERVMN 0501: GNWVRQPEAA VLQKFFRLLA VCHTAIPETD EESGNVSYEA ESPDEAAFVV AAREFGFEFF NRTQNGISFR ELDLVSGEKV ERVYRLLNVL EFNSTRKRMS 0601: VIVRDDDGKL LLLSKGADNV MFERLAKNGR QFEAKTQEHV NQYADAGLRT LVLAYREVDE NEYIEFNKSF NEAKASVSED REALIDEITD KMERDLILLG 0701: ATAVEDKLQN GVPECIDKLA QAGIKIWVLT GDKMETAINI GFASSLLRQE MKQIIINLET PQIKSLEKSG GKDEIELASR ESVVMQLQEG KALLAASGAS 0801: SEAFALIIDG KSLTYALEDE IKKMFLDLAT SCASVICCRS SPKQKALVTR LVKSGTGKTT LAIGDGANDV GMLQEADIGV GISGVEGMQA VMSSDIAIAQ 0901: FRYLERLLLV HGHWCYSRIA SMICYFFYKN ITFGVTVFLY EAYTSFSGQP AYNDWFLSLF NVFFSSLPVI ALGVFDQDVS ARFCYKFPLL YQEGVQNILF 1001: SWKRIIGWMF NGFISALAIF FLCKESLKHQ LFDPDGKTAG REILGGTMYT CVVWVVNLQM ALSISYFTWV QHIVIWGSIA FWYIFLMIYG AMTPSFSTDA 1101: YMVFLEALAP APSYWLTTLF VMIFALIPYF VYKSVQMRFF PKYHQMIQWI RYEGHSNDPE FVEMVRQRSI RPTTVGYTAR RAASVRRSAR FHDQIYKDLV 1201: GV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)