AT3G25180.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.760 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 82, subfamily G, polypeptide 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of CYP82G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 82, subfamily G, polypeptide 1 (CYP82G1); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 9 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 82, subfamily C, polypeptide 4 (TAIR:AT4G31940.1); Has 33970 Blast hits to 33806 proteins in 1725 species: Archae - 58; Bacteria - 3885; Metazoa - 11872; Fungi - 7373; Plants - 9512; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 1264 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:9167443..9169270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58573.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 515 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTFLFSTLQL SLFSLALVIF GYIFLRKQLS RCEVDSSTIP EPLGALPLFG HLHLLRGKKL LCKKLAAMSQ KHGPIFSLKL GFYRLVVASD PKTVKDCFTT 101: NDLATATRPN IAFGRYVGYN NASLTLAPYG DYWRELRKIV TVHLFSNHSI EMLGHIRSSE VNTLIKHLYK GNGGTSIVKI DMLFEFLTFN IILRKMVGKR 201: IGFGEVNSDE WRYKEALKHC EYLAVIPMIG DVIPWLGWLD FAKNSQMKRL FKELDSVNTK WLHEHLKKRS RNEKDQERTI MDLLLDILPE DIVISGHVRD 301: VIVKATILAL TLTGSDSTSI TLTWAVSLLL NNPAALEAAQ EEIDNSVGKG RWIEESDIQN LKYLQAIVKE THRLYPPAPL TGIREAREDC FVGGYRVEKG 401: TRLLVNIWKL HRDPKIWPDP KTFKPERFME DKSQCEKSNF EYIPFGSGRR SCPGVNLGLR VVHFVLARLL QGFELHKVSD EPLDMAEGPG LALPKINPVE 501: VVVMPRLDPK LYSLL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)