AT3G25110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.875 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : fatA acyl-ACP thioesterase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a FatA acyl-ACP thioesterase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
fatA acyl-ACP thioesterase (FaTA); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Acyl-ACP thioesterase (InterPro:IPR002864); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Acyl-ACP thioesterase (TAIR:AT4G13050.1); Has 1414 Blast hits to 1414 proteins in 571 species: Archae - 0; Bacteria - 1089; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 317; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 8 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:9146589..9148273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40821.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 362 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLKLSCNVTD SKLQRSLLFF SHSYRSDPVN FIRRRIVSCS QTKKTGLVPL RAVVSADQGS VVQGLATLAD QLRLGSLTED GLSYKEKFVV RSYEVGSNKT 101: ATVETIANLL QEVGCNHAQS VGFSTDGFAT TTTMRKLHLI WVTARMHIEI YKYPAWGDVV EIETWCQSEG RIGTRRDWIL KDSVTGEVTG RATSKWVMMN 201: QDTRRLQKVS DDVRDEYLVF CPQEPRLAFP EENNRSLKKI PKLEDPAQYS MIGLKPRRAD LDMNQHVNNV TYIGWVLESI PQEIVDTHEL QVITLDYRRE 301: CQQDDVVDSL TTTTSEIGGT NGSATSGTQG HNDSQFLHLL RLSGDGQEIN RGTTLWRKKP SS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)