AT3G23750.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Leucine-rich repeat-containing N-terminal domain, type 2 (InterPro:IPR013210), Leucine-rich repeat (InterPro:IPR001611), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: transmembrane kinase 1 (TAIR:AT1G66150.1); Has 176104 Blast hits to 138784 proteins in 5021 species: Archae - 174; Bacteria - 16889; Metazoa - 56819; Fungi - 11325; Plants - 68733; Viruses - 454; Other Eukaryotes - 21710 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:8558332..8561263 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 99969.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 928 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEAPTPLLLL VLLTTITFFT TSVADDQTAM LALAKSFNPP PSDWSSTTDF CKWSGVRCTG GRVTTISLAD KSLTGFIAPE ISTLSELKSV SIQRNKLSGT 101: IPSFAKLSSL QEIYMDENNF VGVETGAFAG LTSLQILSLS DNNNITTWSF PSELVDSTSL TTIYLDNTNI AGVLPDIFDS LASLQNLRLS YNNITGVLPP 201: SLGKSSIQNL WINNQDLGMS GTIEVLSSMT SLSQAWLHKN HFFGPIPDLS KSENLFDLQL RDNDLTGIVP PTLLTLASLK NISLDNNKFQ GPLPLFSPEV 301: KVTIDHNVFC TTKAGQSCSP QVMTLLAVAG GLGYPSMLAE SWQGDDACSG WAYVSCDSAG KNVVTLNLGK HGFTGFISPA IANLTSLKSL YLNGNDLTGV 401: IPKELTFMTS LQLIDVSNNN LRGEIPKFPA TVKFSYKPGN ALLGTNGGDG SSPGTGGASG GPGGSSGGGG SKVGVIVGVI VAVLVFLAIL GFVVYKFVMK 501: RKYGRFNRTD PEKVGKILVS DAVSNGGSGN GGYANGHGAN NFNALNSPSS GDNSDRFLLE GGSVTIPMEV LRQVTNNFSE DNILGRGGFG VVYAGELHDG 601: TKTAVKRMEC AAMGNKGMSE FQAEIAVLTK VRHRHLVALL GYCVNGNERL LVYEYMPQGN LGQHLFEWSE LGYSPLTWKQ RVSIALDVAR GVEYLHSLAQ 701: QSFIHRDLKP SNILLGDDMR AKVADFGLVK NAPDGKYSVE TRLAGTFGYL APEYAATGRV TTKVDVYAFG VVLMEILTGR KALDDSLPDE RSHLVTWFRR 801: ILINKENIPK ALDQTLEADE ETMESIYRVA ELAGHCTARE PQQRPDMGHA VNVLGPLVEK WKPSCQEEEE SFGIDVNMSL PQALQRWQNE GTSSSTMFHG 901: DFSYSQTQSS IPPKASGFPN TFDSADGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)