AT3G23610.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.337 nucleus 0.306 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : dual specificity protein phosphatase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a dual specificity protein phosphatase whose activity is modulated by CaM binding. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
dual specificity protein phosphatase 1 (DSPTP1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dual-specific/protein-tyrosine phosphatase, conserved region (InterPro:IPR000387), Dual specificity phosphatase (InterPro:IPR020417), Dual specificity phosphatase, catalytic domain (InterPro:IPR000340), Dual specificity phosphatase, subgroup, catalytic domain (InterPro:IPR020422); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MAPK phosphatase 2 (TAIR:AT3G06110.3); Has 4429 Blast hits to 4425 proteins in 398 species: Archae - 22; Bacteria - 149; Metazoa - 2258; Fungi - 464; Plants - 388; Viruses - 233; Other Eukaryotes - 915 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:8478280..8479521 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22018.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 198 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSRDRGSPS SSSSSSSLPG IEKYNEKVKN QIQALVRVIK VARTYRDDNV PSLIEQGLYL GSVAAASNKN VLKSYNVTHI LTVASSLRPA HPDDFVYKVV 101: RVVDKEDTNL EMYFDECVDF IDEAKRQGGS VLVHCFVGKS RSVTIVVAYL MKKHGMTLAQ ALQHVKSKRP VASPNAGFIR QLQDLEKSMQ VSDQFFSF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)