AT3G22920.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cyclophilin-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cyclophilin-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein; FUNCTIONS IN: peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity; INVOLVED IN: protein folding; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: central cell, male gametophyte; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclophilin-like (InterPro:IPR015891), Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type (InterPro:IPR002130); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: rotamase CYP 3 (TAIR:AT2G16600.1); Has 8486 Blast hits to 8480 proteins in 1473 species: Archae - 70; Bacteria - 2102; Metazoa - 2660; Fungi - 1083; Plants - 1079; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 1488 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:8122713..8123411 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26046.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 232 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANPKVFFDL TVDGKPAGRI VIELFADLTP RTAENFRGLC TGERGIGKCG KPIHYKGSTF DHIVPDLMWC GGDIIFENEP IHSEELDDEY FILNHEDGPG 101: IISMADSNGS QFQIHMKDYG LQVDGDHVVI GKVVEGLDLM RNIEKEVITT TTRTPSKPVV IADCGELSDY RSERCYLMKN IEKEVIIKTA KDNKPVVIAD 201: CGGLSDDRSE RYYLINIVVA CMVLMCFWSW FV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)