AT3G21865.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : peroxin 22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Interacts with PEX4 in a yeast two-hybrid. The PEX4 and PEX22 pair may be important during the remodeling of peroxisome matrix contents as glyoxysomes transition to leaf peroxisomes. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
peroxin 22 (PEX22); Has 90 Blast hits to 90 proteins in 43 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 53; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 37 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:7701308..7703218 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31400.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 283 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAESSSPSPT EEIVRLIKRL SAYVAFKMSS LFSTTSIRNL DSRSIGAIAG LAIAVIFTWR AIRTPGEQRQ RRQPKRRIHN AETSSAAAAA SQSNLASSVA 101: PEVSSPREDN AVQDVVDQFF QPVKPTLGQI VRQKLSEGRK VTCRLLGVIL EETSPEELQK QATVRSSVLE VLLEITKYSD LYLMERVLDD ESEAKVLQAL 201: ENAGVFTSGG LVKDKVLFCS TEIGRTSFVR QLEPDWHIDT NPEISTQLAR FIKYQLHVAT VKPERTAPNV FTSQSIEQFF GSV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)