AT3G21760.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:cytosol 0.835 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-Glycosyltransferase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes HYR1, a UDP glycosyltransferase (UGT). HYR1 glucosylates hypostatin, an inhibitor of cell expansion in vivo to form a bioactive glucoside. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
HYPOSTATIN RESISTANCE 1 (HYR1); FUNCTIONS IN: UDP-glycosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-glucosyl transferase 71B6 (TAIR:AT3G21780.1); Has 7489 Blast hits to 7432 proteins in 389 species: Archae - 0; Bacteria - 261; Metazoa - 2177; Fungi - 28; Plants - 4962; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 61 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr3:+:7667099..7668556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 54345.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 4.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 485 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKLELVFIPS PGDGHLRPLV EVAKLHVDRD DHLSITIIII PQMHGFSSSN SSSYIASLSS DSEERLSYNV LSVPDKPDSD DTKPHFFDYI DNFKPQVKAT 101: VEKLTDPGPP DSPSRLAGFV VDMFCMMMID VANEFGVPSY MFYTSNATFL GLQVHVEYLY DVKNYDVSDL KDSDTTELEV PCLTRPLPVK CFPSVLLTKE 201: WLPVMFRQTR RFRETKGILV NTFAELEPQA MKFFSGVDSP LPTVYTVGPV MNLKINGPNS SDDKQSEILR WLDEQPRKSV VFLCFGSMGG FREGQAKEIA 301: IALERSGHRF VWSLRRAQPK GSIGPPEEFT NLEEILPEGF LERTAEIGKI VGWAPQSAIL ANPAIGGFVS HCGWNSTLES LWFGVPMATW PLYAEQQVNA 401: FEMVEELGLA VEVRNSFRGD FMAADDELMT AEEIERGIRC LMEQDSDVRS RVKEMSEKSH VALMDGGSSH VALLKFIQDV TKNIS |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)