AT3G21630.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : chitin elicitor receptor kinase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
LysM receptor-like kinase. Essential in the perception and transduction of the chitin oligosaccharide elicitor. Involved in chitin-mediated plant innate immunity. Located in the plasma membrane. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
chitin elicitor receptor kinase 1 (CERK1); FUNCTIONS IN: transmembrane receptor protein kinase activity, receptor signaling protein activity, kinase activity; INVOLVED IN: defense response to fungus, incompatible interaction, response to chitin, detection of molecule of fungal origin; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidoglycan-binding lysin domain (InterPro:IPR018392), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: protein kinase family protein / peptidoglycan-binding LysM domain-containing protein (TAIR:AT1G51940.1); Has 117788 Blast hits to 116484 proteins in 4898 species: Archae - 166; Bacteria - 13638; Metazoa - 43401; Fungi - 9900; Plants - 32885; Viruses - 579; Other Eukaryotes - 17219 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:7615543..7618530 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 67318.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 617 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKLKISLIAP ILLLFSFFFA VESKCRTSCP LALASYYLEN GTTLSVINQN LNSSIAPYDQ INFDPILRYN SNIKDKDRIQ MGSRVLVPFP CECQPGDFLG 101: HNFSYSVRQE DTYERVAISN YANLTTMESL QARNPFPATN IPLSATLNVL VNCSCGDESV SKDFGLFVTY PLRPEDSLSS IARSSGVSAD ILQRYNPGVN 201: FNSGNGIVYV PGRDPNGAFP PFKSSKQDGV GAGVIAGIVI GVIVALLLIL FIVYYAYRKN KSKGDSFSSS IPLSTKADHA SSTSLQSGGL GGAGVSPGIA 301: AISVDKSVEF SLEELAKATD NFNLSFKIGQ GGFGAVYYAE LRGEKAAIKK MDMEASKQFL AELKVLTRVH HVNLVRLIGY CVEGSLFLVY EYVENGNLGQ 401: HLHGSGREPL PWTKRVQIAL DSARGLEYIH EHTVPVYVHR DIKSANILID QKFRAKVADF GLTKLTEVGG SATRGAMGTF GYMAPETVYG EVSAKVDVYA 501: FGVVLYELIS AKGAVVKMTE AVGEFRGLVG VFEESFKETD KEEALRKIID PRLGDSYPFD SVYKMAELGK ACTQENAQLR PSMRYIVVAL STLFSSTGNW 601: DVGNFQNEDL VSLMSGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)