AT3G21370.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : beta glucosidase 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
beta glucosidase 19 (BGLU19); FUNCTIONS IN: cation binding, hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds, catalytic activity; INVOLVED IN: carbohydrate metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: seed; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycoside hydrolase, family 1 (InterPro:IPR001360), Glycoside hydrolase, family 1, active site (InterPro:IPR018120), Glycoside hydrolase, catalytic core (InterPro:IPR017853), Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core (InterPro:IPR013781); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: beta glucosidase 18 (TAIR:AT1G52400.3); Has 11327 Blast hits to 10978 proteins in 1474 species: Archae - 140; Bacteria - 7823; Metazoa - 717; Fungi - 202; Plants - 1443; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1002 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:7524286..7527579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60018.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 527 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKIPLLGLLL LISLVGSPTR AEEGPVCPKT ETLSRASFPE GFMFGTATAA FQVEGAVNEG CRGPSLWDIY TKKFPHRVKN HNADEAVDFY HRYKEDIQLM 101: KKLNTDGFRL SISWPRIFPH GRMEKGISKE GVQFYHDLID ELLKNDITPL VTVFHWDTPA DLEDEYGGFL SERIVPDFVE YANFTFHEYG DKVKNWITFN 201: EPWVFSRSGY DVGKKAPGRC SPYVKEFGKL CQDGRSGFEP YVVSHNLLVG HAEAVDAFRK CEKCKGGKIG IAHSPAWFEP EDVEGGQATV NRVLDFVIGW 301: HLDPTTFGDY PQSMKDAVGS RLPRFTKAQK AKLKDSTDFV GINYYTSFFA KADQKVDSRN PTWATDALVE FEPKTVDGSI KIGSQPNTAK MAVYAKGLRK 401: LMKYIKDRYN SPEIIITENG YGEDLGDKDT DLSVALNDHN RKYYLQRHLL ALNEAICEDK VNVTSYFLWS LMDNFEWQDG YTARFGVYYI DFKNNLTRME 501: KESAKWLSEF LKPGLKPSKS SKLHEEL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)