AT3G21360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.981 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (InterPro:IPR003819); Has 1029 Blast hits to 1021 proteins in 229 species: Archae - 0; Bacteria - 729; Metazoa - 46; Fungi - 17; Plants - 110; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 127 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:7522865..7524036 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37213.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 330 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAELLLVETP IPQQKHYESK PFPAVISPPS ASIPIPALSL PLFTQTIKTQ KHYLDSLLHE SGAVLFRGFP VNSADDFNDV VEAFGFDELP YVGGAAPRTS 101: VVGRVFTANE SPPDQKIPFH HEMAQVREFP SKLFFYCEIE PKCGGETPIV LSHVVYERMK DKHPEFVQRL EEHGLLYVRV LGEDDDPSSP IGRGWKSTFL 201: THDKNLAEQR AVDLGMKLEW TEDGGAKTVM GPIPAIKYDE SRNRKVWFNS MVAAYTGWED KRNDPRKAVT FGDGKPLPAD IVHDCLRILE EECVAVPWQR 301: GDVLLIDNWA VLHSRRPFDP PRRVLASLCK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)