AT3G21160.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha-mannosidase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an alpha-mannosidase I enzyme responsible for N-glycan maturation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
alpha-mannosidase 2 (MNS2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycoside hydrolase, family 47 (InterPro:IPR001382); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha-mannosidase 1 (TAIR:AT1G51590.1); Has 2046 Blast hits to 1918 proteins in 195 species: Archae - 0; Bacteria - 11; Metazoa - 790; Fungi - 842; Plants - 175; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 228 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:7414129..7418328 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 65139.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 572 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARNKLVSGS HGIWKYFNPA FYLRRPRRLA LLIILFVSVS MVVWDRQSLS RDYQFEVSKL NEEVLRLQQM LEEIKSVTED VSVNSLKDVQ EDPVDAQRMQ 101: RVKEAMVHAW SSYEKYAWGQ DELQPQTKDG VDSFGGLGAT MIDALDTLYI MGLDEQFQKA REWVASSLDF DKDYAASMFE TTIRVVGGLL SAYDLSGDKI 201: FLEKAMDIAD RLLPAWDTQS GIPYNIINLK HGNAHNPTWA GGDSILADSG TEQLEFIALS QRTGDPKYQQ KVEKVISVLN KNFPADGLLP IYINPDTANP 301: SQSTITFGAM GDSFYEYLLK VWVFGNKTSA VKHYRDMWEK SMNGLLSLVK KSTPLSFTYI CEKSGNSLID KMDELACFAP GMLALGASGY SDPAEGKKFL 401: TLAEELAWTC YNFYQSTPTK LAGENYFFNS GSDMSVGTSW NILRPETVES LFYLWRLTGN KTYQEWGWNI FEAFEKNSRI ESGYVGLKDV NTGVKDNKMQ 501: SFFLAETLKY LYLLFSPTTV IPLDEWVFNT EAHPLKIKSR NDQVNLKQSN KVLLRKPAFR IRQRHYGRIT KK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)