AT3G20830.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : AGC (cAMP-dependent, cGMP-dependent and protein kinase C) kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
AGC (cAMP-dependent, cGMP-dependent and protein kinase C) kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: hypocotyl, male gametophyte, root, pedicel, carpel; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), AGC-kinase, C-terminal (InterPro:IPR000961), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT1G51170.1); Has 85073 Blast hits to 71957 proteins in 2517 species: Archae - 46; Bacteria - 10831; Metazoa - 34711; Fungi - 11201; Plants - 11819; Viruses - 155; Other Eukaryotes - 16310 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:7285024..7286250 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45891.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 408 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEPSPSSPPS SPPEILDLDS IKALKILGKG ATGTVFLAHD VVSTSSSSSP FAVKLVPKSS ASSLRRARWE IEVLRRLSVD SNQNPFLPRL LASFESPEYF 101: AWAVPYCSGG DLNVLLHRQN DGVFSSSVIR FYVAEIVCAL EHLHTMGIAY RDLKPENILI QQSGHVTLTD FDLSRSLKKP LRPHFYQPDP ELIIDRKKSR 201: SFSRLISPTA EKNKTGLKKT RSARVNPINR RKTSFSSGER SNSFVGTDEY VSPEVIRGDG HDFAVDWWAL GVLTYEMMYG ETPFKGKSKK ETFRNVLMKE 301: PEFAGKPNDL TDLIRRLLVK DPNRRLGCHR GAAEIKELAF FAGVRWDLLT EVLRPPFIPL RDDGELTVGG FDIREHFEKL RTTPSSAPPS PLRSPPHVCR 401: KNDPFIEF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)