AT3G19280.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.756 What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : fucosyltransferase 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with core α1,3-fucosyltransferase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
fucosyltransferase 11 (FUT11); FUNCTIONS IN: 4-galactosyl-N-acetylglucosaminide 3-alpha-L-fucosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups, fucosyltransferase activity; INVOLVED IN: protein amino acid N-linked glycosylation; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 15 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 10 (InterPro:IPR001503); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fucosyltransferase 12 (TAIR:AT1G49710.1); Has 1598 Blast hits to 1593 proteins in 204 species: Archae - 4; Bacteria - 180; Metazoa - 1025; Fungi - 0; Plants - 132; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 257 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:6681409..6683801 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56208.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 501 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGVFSNLRGP KIGLTHEELP VVANGSTSSS SSPSSFKRKV STFLPICVAL VVIIEIGFLC RLDNASLVDT LTHFFTKSSS DLKVGSGIEK CQEWLERVDS 101: VTYSRDFTKD PIFISGSNKD FKSCSVDCVM GFTSDKKPDA AFGLSHQPGT LSIIRSMESA QYYQENNLAQ ARRKGYDIVM TTSLSSDVPV GYFSWAEYDI 201: MAPVQPKTEK ALAAAFISNC AARNFRLQAL EALMKTNVKI DSYGGCHRNR DGSVEKVEAL KHYKFSLAFE NTNEEDYVTE KFFQSLVAGS VPVVVGAPNI 301: EEFAPSPDSF LHIKQMDDVK AVAKKMKYLA DNPDAYNQTL RWKHEGPSDS FKALIDMAAV HSSCRLCIFV ATRIREQEEK SPEFKRRPCK CTRGSETVYH 401: LYVRERGRFD MESIFLKDGN LTLEALESAV LAKFMSLRYE PIWKKERPAS LRGDGKLRVH GIYPIGLTQR QALYNFKFEG NSSLSTHIQR NPCPKFEVVF 501: V |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)